Poster De Conférence Année : 2020

Evaluation du kit de qPCR Biotoxis pour la détection de Francisella tularensis

Résumé

Objectif – Introduction : La bactérie Francisella tularensis, agent de la tularémie, est catégorisée agent potentiel de bioterrorisme. La détection fiable et rapide de cette bactérie est donc indispensable sur des échantillons biologiques et environnementaux. Le kit de détection qPCR Biotoxis est un test de PCR en temps réel (qPCR) permettant la détection simultanée de trois agents de bioterrorisme : Bacillus anthracis, Yersina pestis, et F. tularensis. Cette étude a évalué les performances de ce kit pour la détection de F. tularensis. Matériels et méthodes : Les performances du kit de détection qPCR Biotoxis ont été évaluées en comparaison à d’autres qPCR (qPCR ISFtu2, qPCR Tul4 et qPCR Type B) utilisées au Centre National de Référence de la Tularémie, sur des souches bactériennes, des échantillons biologiques et des échantillons d’eau. Résultats : Concernant les souches bactériennes, le kit Biotoxis a donné un résultat positif pour 87/87 des souches de F. tularensis subsp. holarctica (type B) mais aussi pour la souche de F. tularensis subsp. novicida. Le kit a donné un résultat négatif pour les deux souches de F. philomiragia et pour 24/24 des souches appartenant à d’autres espèces bactériennes. Pour les 31 échantillons biologiques, la sensibilité du kit Biotoxis était de 90,32% et 96,55%, en comparaison à la qPCR ISFtu2 et à la qPCR Type B respectivement. Les 30 échantillons biologiques précédemment catégorisés négatifs pour la tularémie étaient tous rendus négatifs par le kit Biotoxis. L’étude des échantillons d’eau inoculés par F. tularensis a permis de déterminer une limite de détection du kit Biotoxis de 1000 UFC/l. Concernant l’étude de 57 échantillons d’eau environnementale collectés en France, le kit Biotoxis était positif pour 6/15 des échantillons positifs en qPCR ISFtu2 et pour 4/4 des échantillons positifs en qPCR Type B. Conclusion : En conclusion, le kit de détection qPCR Biotoxis a démontré de bonnes performances pour la détection de F. tularensis dans différents types d’échantillons biologiques et environnementaux. L’amplification croisée de F. tularensis subsp. novicida doit être cependant prise en compte, notamment lors de l’étude d’échantillons environnementaux. Ce test en plaque pourrait être utile pour analyser de grandes séries d’échantillons notamment en cas d’épidémie naturelle ou intentionnelle de tularémie.
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Dates et versions

hal-04960145 , version 1 (21-02-2025)

Identifiants

  • HAL Id : hal-04960145 , version 1

Citer

Aurélie Hennebique, Fabienne Gas, Hélène Batina, Cécilia de Araujo, Karine Bizet, et al.. Evaluation du kit de qPCR Biotoxis pour la détection de Francisella tularensis. 40ème Réunion Interdisciplinaire de Chimiothérapie Anti-Infectieuse, Dec 2020, Paris, France. ⟨hal-04960145⟩
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